Con el apoyo y participación de los miembros de Pro Esteros, científicos y estudiantes de diversas instituciones de estudios superiores como CICESE, IIO, UABC y UNAM, realizamos y apoyamos proyectos de investigación con la finalidad de:

• Promover el mejor entendimiento de estos ecosistemas, para así poder entender mejor su papel ecológico y la riqueza natural que encierran.

• Determinar el estado actual de cada estuario de la Península de Baja California (inalterado, semi-degradado, terriblemente degradado, etc.) y de esta manera poder desarrollar los planes adecuados para su preservación o restauración.

• Brindar información y asesoría científica de alta calidad a las diferentes dependencias del Gobierno de México, que les permita identificar las zonas costeras de mayor importancia y que les sea de mayor utilidad para la aprobación de planes de desarrollo en las areas ya afectadas, evitando un daño a estos ecosistemas.

• Ayudar al Gobierno Mexicano a establecer un sistema de reservas naturales que proteja las lagunas costeras, principalmente las que albergan especies en peligro de extinción.